拳皇99是日本SNK公司于1999年发行的最新一款《拳皇》作品。KOF系列首次引入STRIKER和SUPER CANCEL的概念，并且新增爆气发动的反击模式和防护模式。
草薙京和八神庵乱入
　　八神庵
　　·以完整队伍出战 ·当战胜五队后，评分必须超过200分，甚至280分以上。
　　·达成以上条件后，战胜最终BOSS。
　　·战胜最终BOSS后，游戏的评分在200分以上、280分以下时，隐藏人物 --- “八神庵”便会乱入向玩家发起挑战。
　　草薙京
　　·以完整队伍出战 ·当战胜五队后，评分必须超过200分，甚至280分以上。
　　·达成以上条件后，战胜最终BOSS。
　　·战胜最终BOSS后，游戏的评分在280分以上时，隐藏人物 --- “草薙京”便会乱入向玩家发起挑战。
隐藏结局
　　本作中存有3个隐藏结局，2个特别结局，分别如下：
　　1.选主人公队，打败boss之后出现的真草薙京就会出现和其他队打倒草薙京不一样的剧情
　　2.选饿狼传说队，用不知火舞KO最终boss，那么之后就会出现饿狼队的另一结局
　　3.选超能力战士队，用椎拳崇KO最终boss，那么之后超能力队的结局会有一些变化
　　4.队伍中有草薙京（不能有八神庵，而且不能随机选到），会出现草薙京特有结局
　　5.队伍中有八神庵（不能有草薙京，而且不能随机选到），会出现八神庵特有结局
选用京庵（MVS版专用秘籍）
　　选用草薙京
　　选人时必须有三个人物都选“？”（即随机选人，当然最好是四个都选“？”，这样机会会更大。），如三个随机角色中刚好同时出现K’、马克西马、二阶堂红丸、矢吹真吾、薇普、京-1、京-2这些人的其中任何三位的话，选择此三人出战并打败对手，在胜利后屏幕会显示调用京的指令。 · 在选人画面，将光标移动到“？”处，按住开始键不放，再按如下顺序移动方向：←→↑←↓→，太阳标志处出现京，现在就可以选他了。
　　选用八神庵
　　·选人时必须有三个人物都选“？”（即随机选人，当然最好是四个都选“？”，这样机会会更大。），如三个随机角色中刚好同时出现莉安娜、麻宫雅典娜、包、李香绯、金甲唤、全勋这些人的其中任何三位的话，选择此三人出战并打败对手，在胜利后屏幕会显示调用庵的指令。 在选人画面，将光标移动到“？”处，按住开始键不放，再按如下顺序移动方向：→←↑→↓←，月亮标志处出现八神庵，现在就可以选他了。
　　注：以上两人家用模式下可以直接选用
选用最终bo
　　PS版：游戏难度不限，选用任意角色将TEAM PLAY或SINGLE PLAY通关一次（可续关），通关后存档，接着进入VS模式或练习模式，在选人画面按住START键后输入BADC（即○、×、□、△），成功的话boss（仅限第二形态）会出现在问号（随机选人）下方
　　注：DC版可直接使用（也仅限第二形态）
DC版隐藏援护
　　DC版的Xtra援护分别是：塞斯（セス,Seth）、瓦妮莎（ヴァネッサ，Vanessa）（注意这两人的初次登场不是在2000，而是99EVO，这点更正下）、草薙京学生装、雅典娜学生装、神乐千鹤（神楽 ちづる）、山崎龙二（山崎 竜二，Ryuji Yamazaki）、比利卡恩（ビリー・カーン，Billy Kane）、大门五郎（大门 五郎，Goro Daimon）、阿尔弗雷德（アルフレッド，Alfred）、菲奥（フィオ，Fio）、天童凯（天童 凯，Gai Tendo）和雾岛翔（雾岛 翔，Syo Kirishima）
　　其中塞斯和瓦妮莎是一开始就能用，而且不区分善版和恶版
　　先买下草、小雅、千鹤、龙二、比利和大门的善版（通过Battle Ability购买，好像升Lv.1是800分），之后再买下阿尔弗雷德和菲奥的善版（升Lv.1好像是2000分），就可以买除阿和菲之外那六人的恶版，这六个恶版买下后就可以买阿和菲的恶版（注意买下后可以升级，最高Lv.3）
　　至于凯和翔则必须通过DC机与NeoGeo Pocket(Color)联动后才能使用，而且NGP(C)必须有The King Of Fighters Battle De Paradise的存档，也有善版和恶版，不过不能升级，PC版的可以直接使用，PS2版则是所有Xtra援护都能直接使用